Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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PRKCHP24723 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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