Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AC104574.1-201ENST00000561182 925 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AC097634.1-201ENST00000604491 2467 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 CPEB2-AS1-202ENST00000501916 1806 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRCP08575 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.7 ms