Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LRRTM2O43300 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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