Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.9 ms