Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 MIR205HG-210ENST00000603283 455 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 CUX2P1-201ENST00000606426 298 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 CCL14-202ENST00000618404 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 METAP1-212ENST00000625963 147 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 LINC01440-208ENST00000627300 699 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC233280.20-201ENST00000637412 416 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 LPAL2-203ENST00000454031 2498 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC244502.1-201ENST00000514473 1951 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 NME8-201ENST00000199447 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 PWRN1-212ENST00000569908 1435 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 FIGNL1-213ENST00000615084 3368 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 TEX11-204ENST00000395889 3133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 RGS8-203ENST00000367557 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 TRBV9-201ENST00000390363 390 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 LINC01704-201ENST00000414848 834 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AL133268.2-201ENST00000416595 430 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC239800.1-201ENST00000442049 719 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC016559.1-201ENST00000511420 199 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC037450.1-201ENST00000518129 647 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC011410.1-201ENST00000524175 705 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AP000880.1-202ENST00000526487 588 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 OR7E96P-201ENST00000530816 976 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC115676.1-201ENST00000538416 329 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC087257.2-201ENST00000538759 928 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AL358292.1-201ENST00000554181 412 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AL136018.1-202ENST00000555300 488 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 SCIMP-204ENST00000574297 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC118757.1-202ENST00000589074 609 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC108861.1-201ENST00000611634 585 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC006335.3-201ENST00000613408 292 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 PDZK1P1-201ENST00000401008 3498 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 WDPCP-204ENST00000409199 2466 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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