Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 PPP1R2P6-201ENST00000478565 588 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC013546.1-201ENST00000523232 564 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AP000873.2-209ENST00000528083 547 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC044860.3-201ENST00000559957 368 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC061975.3-201ENST00000583209 244 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 RPSAP66-201ENST00000592196 606 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AL031429.2-201ENST00000602605 649 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC019080.4-201ENST00000606200 564 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 FKBP1AP4-201ENST00000631775 336 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 ARF4-209ENST00000496292 1467 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 LARP1B-203ENST00000432347 2707 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 CASP10-203ENST00000313728 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 PDE8B-208ENST00000505283 3474 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 ATP5J2-201ENST00000292475 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 RPL24P4-201ENST00000326586 421 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 RNU12-2P-201ENST00000364789 156 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC074375.1-201ENST00000372993 192 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 FAM107B-203ENST00000378462 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 SMPX-201ENST00000379494 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 BX284668.3-201ENST00000414128 882 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 RPSAP60-201ENST00000415403 880 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 LINC01980-202ENST00000425195 491 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AL353803.3-201ENST00000444641 335 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC009411.2-201ENST00000458359 539 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 BX323845.2-201ENST00000458382 234 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 RPL5P15-201ENST00000475870 897 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AP005202.1-201ENST00000489915 867 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC008040.4-201ENST00000494834 768 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC106760.2-201ENST00000504159 619 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 AC025176.1-201ENST00000510261 365 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
DTX3Q8N9I9 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms