Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC008013.2-201ENST00000537555 348 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 LINC02389-202ENST00000540024 557 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 HIGD1AP9-201ENST00000550710 279 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 NR2F2-AS1-205ENST00000559505 1005 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC015818.3-202ENST00000579603 283 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 TATDN1-220ENST00000605953 726 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 MIR6751-201ENST00000610479 63 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC133485.6-201ENST00000624045 688 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 CR589904.1-203ENST00000636515 318 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 OR1K1-201ENST00000277309 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC074375.1-201ENST00000372993 192 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 OR10A4-201ENST00000379829 995 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 LINC00869-202ENST00000430442 1065 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 LINC01827-201ENST00000432711 555 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 OSTCP2-201ENST00000437956 444 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 E2F6P3-201ENST00000441743 743 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AL353803.3-201ENST00000444641 335 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 RPS2P25-201ENST00000467247 580 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 ANK3-213ENST00000486349 493 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AL157871.5-201ENST00000555212 533 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC027020.1-202ENST00000557839 429 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 RN7SL664P-201ENST00000584239 305 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 ZNF397-211ENST00000592264 1104 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC092960.1-201ENST00000604762 351 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
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