Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 HTR1D-201ENST00000374619 2835 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 NEDD9-208ENST00000504387 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 OR4F5-201ENST00000335137 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 RPL9P21-201ENST00000392269 505 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 DUTP4-201ENST00000424782 475 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 CCNJP1-201ENST00000450600 1149 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC023421.2-202ENST00000586213 547 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AP002345.2-201ENST00000609961 904 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 UMAD1-206ENST00000636849 2157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AP005139.1-201ENST00000580702 1647 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 SLC22A25-201ENST00000306494 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.3 ms