Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 PYHIN1-204ENST00000392252 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 MYCBP2-212ENST00000612956 1542 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RNA5SP114-201ENST00000363780 113 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC074375.1-201ENST00000372993 192 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 NRIR-202ENST00000414795 506 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 CCR8-202ENST00000414803 1078 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC007349.3-201ENST00000415356 872 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC012485.2-201ENST00000437372 982 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AL158214.1-201ENST00000444423 404 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AL391863.1-202ENST00000457427 612 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 CREM-242ENST00000490511 469 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 TECRP2-201ENST00000503270 928 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC073648.3-201ENST00000504939 925 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RN7SKP11-201ENST00000517018 287 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AP001646.2-201ENST00000528645 1156 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC068418.1-201ENST00000582990 404 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 ZNF431-203ENST00000594425 610 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC020914.7-201ENST00000594477 545 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC239809.3-203ENST00000611286 1050 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 Six3os1_1.1-201ENST00000620900 87 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 BCL2L14-203ENST00000308721 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 DAZ1-203ENST00000426000 1846 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 ATP5BP1-201ENST00000411980 1574 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC009743.1-201ENST00000415774 610 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AL359633.1-201ENST00000421403 310 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms