Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.8 ms