Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 CCDC60-203ENST00000536742 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 AL359839.1-201ENST00000451975 1160 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ZNF879B4DU55 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms