Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 CEACAMP11-201ENST00000455211 583 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms