Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 VN1R3-201ENST00000418822 919 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms