Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC37A3-202ENST00000340308 2955 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 GTF2IP1-205ENST00000618412 2990 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPK10-274ENST00000641120 2456 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MESD-206ENST00000561312 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MYO6-208ENST00000627432 4074 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 IGHV1OR15-9-201ENST00000338912 353 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR345-201ENST00000362114 98 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PLA2G2E-201ENST00000375116 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 UQCRQ-202ENST00000378667 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR602-201ENST00000384960 98 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 IGLV3-21-201ENST00000390308 602 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC109638.1-201ENST00000417406 326 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TUBB8P9-201ENST00000422534 1276 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC106017.1-201ENST00000428348 440 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC253536.1-201ENST00000437021 315 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 HNRNPA1P3-201ENST00000440968 551 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC007952.3-201ENST00000442355 440 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AL008718.1-201ENST00000445867 487 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 FLNC-AS1-201ENST00000469965 559 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008021.1-201ENST00000474180 414 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RPARP-AS1-203ENST00000494270 711 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC007952.8-202ENST00000495691 440 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC084866.1-201ENST00000508955 554 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 GOT1L1-202ENST00000518826 497 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TUBB4BP4-201ENST00000527023 304 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AP001775.1-201ENST00000532608 586 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 KRTAP2-2-202ENST00000542910 390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PEBP1P1-201ENST00000554856 510 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SPATA8-202ENST00000558553 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF213-AS1-208ENST00000575139 530 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PPIAL4C-201ENST00000585245 600 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010636.2-201ENST00000595094 522 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 OR7A18P-201ENST00000600416 277 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 OR1X1P-201ENST00000606159 931 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AL590705.1-201ENST00000607322 484 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR7704-201ENST00000610524 59 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6741-201ENST00000618782 63 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CD38-201ENST00000226279 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MSRB3-212ENST00000614640 4270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ACOX2-201ENST00000302819 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MGC15885-201ENST00000558940 2425 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA1C-207ENST00000399597 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms