Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC103564.3-201ENST00000621194 220 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AF186192.2-204ENST00000581667 524 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC012594.1-252ENST00000595011 876 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 uc_338.33-201ENST00000614988 170 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 ZNF710-AS1-202ENST00000620791 2133 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD42Q8N9B4 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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