Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 CDY5P-201ENST00000411487 1580 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 CDY9P-201ENST00000451397 1580 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 NSUN4-208ENST00000498008 3867 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.9 ms