Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC009237.9-201ENST00000414800 347 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 MIR181A1HG-202ENST00000432296 930 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 LINC01431-203ENST00000452395 505 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 RN7SL228P-201ENST00000470060 303 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC108159.1-201ENST00000505408 489 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AL158068.2-201ENST00000510632 563 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC084026.1-201ENST00000522028 564 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 SLC25A51P2-201ENST00000535708 889 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC013652.1-204ENST00000558209 489 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC087499.3-201ENST00000578210 717 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC244196.4-201ENST00000611787 392 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 ALKAL2-208ENST00000619265 496 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC243725.1-201ENST00000637164 436 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
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VAMP3Q15836 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
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VAMP3Q15836 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
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VAMP3Q15836 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
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VAMP3Q15836 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
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VAMP3Q15836 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 MS4A6A-213ENST00000530839 1383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 OR13F1-201ENST00000334726 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
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VAMP3Q15836 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 OR2T4-202ENST00000366475 1047 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 C1orf146-202ENST00000370375 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 TRAV6-201ENST00000390428 404 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 OR7E91P-201ENST00000400027 866 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AL161725.1-203ENST00000415004 1081 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 PUDPP2-201ENST00000431423 643 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC105393.2-201ENST00000431911 549 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 RNF216-IT1-201ENST00000443837 337 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 EFCAB2-207ENST00000447569 527 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 HIST1H2APS6-201ENST00000448609 364 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC019080.2-201ENST00000453859 394 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC016822.1-201ENST00000457975 439 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 RN7SL571P-201ENST00000468302 295 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AL928654.1-201ENST00000476081 354 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 RN7SL702P-201ENST00000488394 292 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC114947.1-201ENST00000511991 432 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC098679.3-203ENST00000514881 919 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
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