Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 PROM1-219ENST00000539194 3884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AC091390.2-201ENST00000432573 374 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AL392046.1-201ENST00000450742 569 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AC106800.2-201ENST00000514009 1103 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AP005139.1-201ENST00000580702 1647 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 811.9 ms