Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 C6orf89-204ENST00000480824 6861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 ERBB4-202ENST00000342788 12136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 PCNX1-201ENST00000304743 12919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 SLC12A6-201ENST00000290209 7286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms