Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
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ITGB3BPQ13352 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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ITGB3BPQ13352 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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ITGB3BPQ13352 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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ITGB3BPQ13352 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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ITGB3BPQ13352 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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ITGB3BPQ13352 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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