Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK2Q13002 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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