Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 MR1-204ENST00000367580 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 OPCML-203ENST00000524381 6424 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 GCNT3-201ENST00000396065 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 CLASP1-208ENST00000455322 5660 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 CTNND1-221ENST00000529873 5931 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 ADGRL3-214ENST00000511324 5042 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 SPHKAP-202ENST00000392056 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 ZEB2-232ENST00000636026 5172 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 RIF1-205ENST00000444746 7897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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