Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SREBF2Q12772 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
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