Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TTPAP49638 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TTPAP49638 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TTPAP49638 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TTPAP49638 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TTPAP49638 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TTPAP49638 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TTPAP49638 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TTPAP49638 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TTPAP49638 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TTPAP49638 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TTPAP49638 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TTPAP49638 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TTPAP49638 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TTPAP49638 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TTPAP49638 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 LINC02218-202ENST00000504998 582 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TTPAP49638 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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