Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TMPOP42166 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TMPOP42166 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TMPOP42166 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TMPOP42166 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TMPOP42166 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TMPOP42166 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TMPOP42166 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TMPOP42166 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TMPOP42166 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TMPOP42166 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TMPOP42166 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TMPOP42166 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TMPOP42166 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TMPOP42166 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
TMPOP42166 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TMPOP42166 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TMPOP42166 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TMPOP42166 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TMPOP42166 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
TMPOP42166 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TMPOP42166 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TMPOP42166 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TMPOP42166 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TMPOP42166 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TMPOP42166 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TMPOP42166 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TMPOP42166 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TMPOP42166 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TMPOP42166 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TMPOP42166 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TMPOP42166 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TMPOP42166 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TMPOP42166 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TMPOP42166 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TMPOP42166 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TMPOP42166 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TMPOP42166 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TMPOP42166 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TMPOP42166 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TMPOP42166 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TMPOP42166 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TMPOP42166 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TMPOP42166 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TMPOP42166 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TMPOP42166 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TMPOP42166 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TMPOP42166 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TMPOP42166 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TMPOP42166 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TMPOP42166 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TMPOP42166 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMPOP42166 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMPOP42166 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMPOP42166 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TMPOP42166 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TMPOP42166 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMPOP42166 OR51B4-201ENST00000380224 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMPOP42166 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TMPOP42166 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TMPOP42166 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMPOP42166 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMPOP42166 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TMPOP42166 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TMPOP42166 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TMPOP42166 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TMPOP42166 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMPOP42166 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TMPOP42166 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMPOP42166 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TMPOP42166 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMPOP42166 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMPOP42166 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMPOP42166 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TMPOP42166 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TMPOP42166 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMPOP42166 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMPOP42166 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMPOP42166 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.31
TMPOP42166 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
TMPOP42166 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
TMPOP42166 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
TMPOP42166 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
TMPOP42166 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.31
TMPOP42166 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
TMPOP42166 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
TMPOP42166 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
TMPOP42166 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
TMPOP42166 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TMPOP42166 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TMPOP42166 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TMPOP42166 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TMPOP42166 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TMPOP42166 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TMPOP42166 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TMPOP42166 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TMPOP42166 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TMPOP42166 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TMPOP42166 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms