Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC079414.3-201ENST00000612986 1090 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms