Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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USP18Q9UMW8 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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USP18Q9UMW8 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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