Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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SNX15Q9NRS6 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SNX15Q9NRS6 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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