Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC009135.2-201ENST00000624136 1768 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TM6SF1Q9BZW5 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms