Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 ATP5G2-205ENST00000549748 728 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC068254.1-201ENST00000584753 483 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 FXYD6P1-201ENST00000604857 285 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 HOXA11-AS1_3.1-201ENST00000613383 98 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC106782.7-201ENST00000624024 418 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC133555.5-201ENST00000624430 418 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 NPPA-AS1-201ENST00000400892 936 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC073115.2-201ENST00000416708 555 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC245140.1-201ENST00000433825 341 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 OR7E7P-201ENST00000455678 1012 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 RN7SL390P-201ENST00000470634 284 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 RN7SL776P-201ENST00000493390 268 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 LINC01950-202ENST00000513273 572 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 PDCL3P1-201ENST00000534575 734 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC021979.2-201ENST00000553644 209 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 LINC02308-201ENST00000555001 637 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC091304.4-201ENST00000565703 620 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 PPIAL4C-201ENST00000585245 600 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AL121782.1-201ENST00000611242 413 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 ALKAL2-208ENST00000619265 496 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 HRG-201ENST00000232003 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms