Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SPHKAPQ2M3C7 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SPHKAPQ2M3C7 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SPHKAPQ2M3C7 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SPHKAPQ2M3C7 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SPHKAPQ2M3C7 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SPHKAPQ2M3C7 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SPHKAPQ2M3C7 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SPHKAPQ2M3C7 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SPHKAPQ2M3C7 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SPHKAPQ2M3C7 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SPHKAPQ2M3C7 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SPHKAPQ2M3C7 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 ZNF365-204ENST00000395251 2695 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 AC079414.3-201ENST00000612986 1090 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 APOOL-203ENST00000622540 6466 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 PLXNC1-205ENST00000547057 2455 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 MCM8-205ENST00000610722 7486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 EPS15P1-202ENST00000459691 2071 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 AC007620.2-201ENST00000600539 1697 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 DPY19L3-202ENST00000392250 5998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 MFAP3L-203ENST00000393704 5827 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SPHKAPQ2M3C7 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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