Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms