Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 HEMGN-201ENST00000259456 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 ETS1-202ENST00000392668 5139 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 ITK-201ENST00000422843 4528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 MEGF10-203ENST00000503335 7571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 HRH1-201ENST00000397056 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 PUM1-205ENST00000424085 4631 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 UNC79-205ENST00000555664 8484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 PAN2-221ENST00000610546 5301 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 ABHD2-201ENST00000352732 8735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 CCDC85C-201ENST00000380243 16393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 DNAJA1P6-201ENST00000437347 354 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 KIAA1671-206ENST00000637069 6510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 KIAA1328-207ENST00000591619 5881 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 MYLK4-201ENST00000274643 5806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 HRNR-201ENST00000368801 9623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 SVIL-202ENST00000375398 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
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