Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
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NRF1Q16656 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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NRF1Q16656 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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NRF1Q16656 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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