Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 CYTOR-207ENST00000414584 772 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 GCSAM-202ENST00000460387 623 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 RN7SL445P-201ENST00000495609 293 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AC106760.2-201ENST00000504159 619 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AC010634.1-201ENST00000513925 540 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 C8orf37-AS1-201ENST00000517437 456 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AC023866.2-201ENST00000521378 387 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AC084033.2-201ENST00000551532 967 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 Z83818.2-201ENST00000635331 433 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 RNA5SP301-201ENST00000362537 121 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 RSPO3-202ENST00000368317 1290 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 S100A7-201ENST00000368722 442 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 LINC01353-201ENST00000412772 775 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AL590095.1-201ENST00000420049 436 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 RPS21P1-201ENST00000434479 247 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.9 ms