Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
USF2Q15853 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USF2Q15853 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
USF2Q15853 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 MS4A3-201ENST00000278865 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AL359232.1-202ENST00000556874 1206 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
USF2Q15853 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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