Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 LINC01773-201ENST00000437598 787 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
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SIX1Q15475 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
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