Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CYTH1Q15438 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms