Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AC021079.1-201ENST00000625268 907 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 CAGE1-203ENST00000379918 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 OR11G2-203ENST00000641879 4415 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 TCF4-225ENST00000564999 3590 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 FGF10-201ENST00000264664 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
R3HDM1Q15032 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms