Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RFTN1Q14699 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AC138627.1-204ENST00000641894 765 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms