Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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ITGA9Q13797 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
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ITGA9Q13797 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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ITGA9Q13797 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ITGA9Q13797 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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