Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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CHAF1AQ13111 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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CHAF1AQ13111 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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