Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC004870.2-201ENST00000445615 831 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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