Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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PTPRAP18433 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 Metazoa_SRP.106-201ENST00000622471 296 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 MBD5-201ENST00000404807 5920 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
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PTPRAP18433 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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PTPRAP18433 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
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PTPRAP18433 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
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PTPRAP18433 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
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PTPRAP18433 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
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PTPRAP18433 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
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PTPRAP18433 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
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