Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ODC1P11926 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ODC1P11926 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ODC1P11926 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ODC1P11926 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ODC1P11926 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ODC1P11926 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ODC1P11926 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ODC1P11926 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ODC1P11926 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ODC1P11926 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ODC1P11926 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ODC1P11926 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ODC1P11926 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ODC1P11926 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ODC1P11926 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ODC1P11926 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ODC1P11926 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ODC1P11926 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ODC1P11926 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ODC1P11926 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ODC1P11926 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ODC1P11926 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ODC1P11926 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ODC1P11926 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ODC1P11926 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ODC1P11926 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ODC1P11926 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ODC1P11926 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ODC1P11926 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ODC1P11926 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ODC1P11926 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ODC1P11926 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ODC1P11926 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ODC1P11926 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ODC1P11926 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ODC1P11926 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ODC1P11926 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ODC1P11926 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ODC1P11926 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ODC1P11926 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ODC1P11926 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ODC1P11926 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ODC1P11926 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ODC1P11926 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ODC1P11926 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ODC1P11926 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ODC1P11926 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
ODC1P11926 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
ODC1P11926 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
ODC1P11926 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ODC1P11926 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ODC1P11926 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ODC1P11926 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ODC1P11926 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ODC1P11926 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ODC1P11926 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ODC1P11926 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ODC1P11926 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ODC1P11926 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ODC1P11926 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ODC1P11926 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ODC1P11926 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ODC1P11926 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ODC1P11926 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ODC1P11926 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ODC1P11926 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ODC1P11926 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ODC1P11926 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ODC1P11926 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ODC1P11926 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ODC1P11926 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ODC1P11926 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ODC1P11926 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ODC1P11926 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ODC1P11926 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ODC1P11926 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ODC1P11926 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ODC1P11926 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ODC1P11926 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ODC1P11926 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ODC1P11926 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ODC1P11926 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ODC1P11926 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ODC1P11926 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ODC1P11926 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ODC1P11926 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ODC1P11926 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ODC1P11926 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ODC1P11926 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ODC1P11926 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ODC1P11926 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ODC1P11926 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ODC1P11926 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ODC1P11926 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ODC1P11926 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ODC1P11926 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ODC1P11926 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ODC1P11926 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ODC1P11926 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.1 ms