Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FAM200BP0CF97 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.5 ms