Protein–RNA interactions for Protein: D6R9N7

USP17L18, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L18D6R9N7 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC112225.1-201ENST00000508230 297 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC7.9□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 ADH1B-201ENST00000305046 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 CA10-204ENST00000570565 2276 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 SLC13A1-204ENST00000539873 2222 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 BEST3-202ENST00000330891 3532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 CYP2C8-212ENST00000623108 1962 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 AL450423.1-201ENST00000615176 1857 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 MUC21-201ENST00000376296 3651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 AC068189.1-201ENST00000501164 2632 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 SLC4A4-204ENST00000425175 7596 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 ZNF841-201ENST00000389534 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 OFD1P10Y-201ENST00000434110 1433 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 DLG2-201ENST00000280241 7730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 TRIM49B-202ENST00000622138 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 HIST1H2BA-201ENST00000274764 516 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 AL356309.1-201ENST00000425153 339 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 AL035420.1-202ENST00000450129 357 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 PGAP2-210ENST00000464441 699 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 RPS14P8-201ENST00000478778 369 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 AC068831.6-201ENST00000560522 795 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
USP17L18D6R9N7 AL354702.2-202ENST00000641481 890 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms