Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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USP18Q9UMW8 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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USP18Q9UMW8 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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USP18Q9UMW8 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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USP18Q9UMW8 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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