Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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