Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC068491.1-201ENST00000449539 1241 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAM2Q15035 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms